首先要明白，离职直接走扣工资的做法不合法。
离职直接走，如果前提是单位不存在任何法定过错，劳动者直接走人，不辞而别，虽然属于违法解除劳动合同，但是用人单位也只能助长由此给单位造成的实际损失，该主张的实现还要通过仲裁和诉讼解决。直接扣工资的行为不合法，是因为直接扣工资的话，相当于在劳动合同中约定了：“员工违法解除劳动合同的违约金---扣工资”，而按照《劳动合同法》第条的规定，除了因服务期和竞业限制情形外，不得在劳动合同中约定由劳动者承担违约金。所以，这种实质上是要求劳动者承担离职违约金的做法违法，无效。
如果单位存在《劳动合同法》第条规定的违法行为（未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的； 未及时足额支付劳动报酬的；未依法为劳动者缴纳社会保险费的；用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的；因本法第二十六条第一款规定的情形致使劳动合同无效的；法律、行政法规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形），员工可以直接走（通知一下立即走），此时，劳动者的解除劳动合同的行为是合法的，用人单位更无权扣发工资了。
其次，虽然明知不合法，但是实务中仍有很多单位如此操作。员工该如何处理？自然是去劳动监察大队举报单位克扣工资了。如果还涉及经济补偿或赔偿金等争议，则可以直接申请仲裁解决。
